O gás no trato digestivo (isto é, esôfago, estômago, intestino delgado e intestino grosso) provém de duas fontes:
O ar deglutido (aerofagia) é uma causa comum de gás no estômago. Todo mundo engole pequenas quantidades de ar quando come ou bebe. Entretanto, se comer ou beber rapidamente, mascar chicletes, fumar ou usar dentaduras frouxas podem fazer que algumas pessoas deglutam maior quantidade de ar.
O arroto é a maneira pela qual o ar engolido - que contém nitrogênio, oxigênio e dióxido de carbono - deixa o estômago. O restante do gás se move para o intestino delgado, onde é parcialmente absorvido. Uma pequena porção viaja até o intestino grosso e é liberado através do reto (o estômago também libera dióxido de carbono quando se mistura o ácido gástrico e bicarbonato, mas a maioria deste gás é absorvido para a circulação sanguínea e não entra no intestino grosso).
O corpo não digere e absorve alguns carboidratos (o açúcar, amido e fibras encontradas em muitos alimentos) no intestino delgado por causa da diminuição ou ausência de certas enzimas. Este alimento não digerido passa do intestino delgado para o intestino grosso, onde as bactérias inofensivas, normais, digerem o alimento produzindo hidrogênio, dióxido de carbono e, em cerca de 1/3 das pessoas, metano. Eventualmente estes gases saem pelo reto.
As pessoas que produzem metano não passam necessariamente mais gás ou têm sintomas únicos. Uma pessoa que produz metano terão fezes que flutuam consistentemente na água. As pesquisas não evidenciaram porque algumas pessoas produzem metano e outras não.
Os alimentos que produzem gás numa pessoa pode não causar em outra. Algumas bactérias comuns no intestino grosso podem destruir o hidrogênio produzido por outra bactéria. O equilíbrio dos dois tipos de bactérias pode explicar porque algumas pessoas têm mais gás que outras.